派作为核心策略元素，虽然功能强大但存在明确限制。每个派的选择与舰队编组直接绑定，无法在单局游戏中随意切换，这意味着一旦选定某种派系，整局游戏都将受其特性约束。灵活调整策略的空间被压缩，必须提前根据任务类型和舰队构成做好规划。进攻型、防御型或探索型的派系加成差异明显，选错可能导致战斗劣势。
派的技能加成存在冷却时间和范围限制。例如增加伤害或提升速度的被动效果仅在特定条件下触发，且无法叠加同类加成。部分派系的专属技能如加强防御或探索效率，使用时需要消耗资源或满足人数要求，过度依赖单一技能可能影响整体节奏。合理分配技能使用次数是关键，盲目发动可能导致关键时刻无技可用。
派的选择受任务类型强制约束。某些高难度任务会锁定特定派系，比如维修任务强制使用工程师派系，而侦查任务则限定探索型派系。这种设计虽然提升代入感，但也限制了自由组合的可能性。任务开始前务必确认派系匹配度，否则可能因属性不符导致任务失败或效率低下。
个人偏好与团队协作会产生隐性限制。喜欢进攻型派系的玩家可能在团队中需要妥协选择防御型派系以保证阵容平衡。多人模式下派系组合需要避免重复，重复选择相同派系会导致加成效果衰减。沟通协调是解决这个问题的核心，单方面坚持偏好可能影响团队整体实力。
提前规划舰队构成、注意技能冷却、匹配任务需求以及注重团队配合，这些都能有效规避限制带来的负面影响。掌握这些要点后，派系系统将成为探索太空的强力助手而非束缚。
